More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4767 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.06 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  56.6 
 
 		 283 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 283 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  55.09 
 
 		 283 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  52.13 
 
 		 288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  53 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.44 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 301 aa  289  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  34.8 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.59 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  30.9 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  28.36 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  31.69 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  30.21 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  31.18 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>