More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3724 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
461 aa  893    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.05 
 
 
456 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.39 
 
 
460 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.18 
 
 
460 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
489 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.67 
 
 
469 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 
484 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.92 
 
 
464 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.97 
 
 
484 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
479 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 
466 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.47 
 
 
490 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
487 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.73 
 
 
480 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.69 
 
 
474 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.28 
 
 
489 aa  323  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.73 
 
 
464 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
479 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 
481 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.61 
 
 
483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
470 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 
470 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.09 
 
 
497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
500 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 
465 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.2 
 
 
511 aa  272  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.15 
 
 
469 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 
515 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.77 
 
 
511 aa  269  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
455 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.68 
 
 
458 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.34 
 
 
466 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.49 
 
 
488 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.92 
 
 
482 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.89 
 
 
482 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.13 
 
 
475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.91 
 
 
475 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.59 
 
 
472 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.77 
 
 
475 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.11 
 
 
494 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.39 
 
 
616 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  29.03 
 
 
489 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.4 
 
 
473 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  28.15 
 
 
714 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.36 
 
 
462 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 
489 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.74 
 
 
456 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  31.84 
 
 
455 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.58 
 
 
495 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.8 
 
 
472 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  27.37 
 
 
460 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  28.23 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.04 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.76 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.59 
 
 
492 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  29.79 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  31 
 
 
459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.88 
 
 
465 aa  146  9e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  27.89 
 
 
714 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.94 
 
 
459 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  30.95 
 
 
507 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.86 
 
 
470 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.13 
 
 
546 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 
470 aa  144  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  31.41 
 
 
486 aa  143  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.19 
 
 
482 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.04 
 
 
475 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.15 
 
 
458 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  35.24 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  29.59 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  29.59 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.24 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.65 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.88 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  29.59 
 
 
590 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.54 
 
 
480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  34.19 
 
 
565 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
470 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
470 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
470 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  29.81 
 
 
457 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  32.9 
 
 
477 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.66 
 
 
474 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>