More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0328 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0328  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  68.22 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.61 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.91 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00241  VirG  51.28 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  48.31 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  46.69 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  44.03 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.83 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6145  two-component response regulator VirG  42.26 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  44.16 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8217  two-component response regulator VirG  44.35 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.206668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.93 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 240 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.13 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.13 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.76 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  42.56 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.42 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  41.53 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  41.53 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  41.25 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  39.91 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  40.66 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  40.66 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  40.66 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  40.66 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  40.08 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  40.83 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  39.48 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  43.04 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>