More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4950 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.77 
 
 
266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.38 
 
 
270 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.63 
 
 
260 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.63 
 
 
260 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
275 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 
275 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 
273 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.23 
 
 
273 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
275 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
275 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.5 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  56.3 
 
 
261 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 
261 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  56.25 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.37 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.59 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
274 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  58.13 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 
264 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
270 aa  259  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 
266 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  54.12 
 
 
262 aa  259  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 
264 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 
290 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 
290 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
264 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
261 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
261 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
264 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
264 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
261 aa  254  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.06 
 
 
265 aa  254  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  51.38 
 
 
277 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
262 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 
261 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.99 
 
 
269 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.73 
 
 
274 aa  244  9e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.4 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 
262 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  50.99 
 
 
269 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
269 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
265 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  53.97 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
269 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
260 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
269 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  53.96 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  52.42 
 
 
269 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
257 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
273 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.8 
 
 
272 aa  208  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  48.8 
 
 
272 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.06 
 
 
269 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.08 
 
 
270 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
261 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 
263 aa  198  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
269 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.46 
 
 
257 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
258 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
257 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
263 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
255 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
264 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
258 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
259 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
262 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
258 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
264 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.27 
 
 
258 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
258 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
264 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
257 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
257 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
264 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
261 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>