68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0926 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  90.61 
 
 		 458 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 458 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  90.83 
 
 		 458 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  61.83 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  61.48 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  60.69 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 		 471 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  35.16 
 
 		 474 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  35.61 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  34.37 
 
 		 490 aa  213  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  36.06 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  35.7 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  34.16 
 
 		 460 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  35.41 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  33.1 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  34.37 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  32.19 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 		 456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  32.97 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  25.18 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  24.12 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  30.9 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  25.78 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  31.18 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 492 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  32 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  28.98 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 447 aa  50.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.18 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 		 463 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 536 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  29.89 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 504 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  27.57 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>