More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2732 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2732  tyrosine kinase  100 
 
 
303 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0677811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  60.42 
 
 
315 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2365  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  63.25 
 
 
306 aa  367  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0244  protein-tyrosine kinase  44.77 
 
 
309 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1879  protein-tyrosine kinase  43.8 
 
 
299 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1377  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.91 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  40.85 
 
 
298 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1793  hypothetical protein  37.45 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.677381  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0150  hypothetical protein  36.3 
 
 
289 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.17 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  34.15 
 
 
225 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  39.71 
 
 
756 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.66 
 
 
257 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.17 
 
 
225 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  40.49 
 
 
496 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  34.15 
 
 
225 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  35.55 
 
 
790 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  32.68 
 
 
225 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.44 
 
 
454 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33 
 
 
745 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  35.19 
 
 
780 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  33.18 
 
 
743 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.8 
 
 
464 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.2 
 
 
719 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  32.2 
 
 
719 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  32.2 
 
 
719 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  32.2 
 
 
719 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.92 
 
 
228 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.92 
 
 
228 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  34.45 
 
 
509 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  32.2 
 
 
719 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.82 
 
 
790 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  29.03 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  33.01 
 
 
721 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  33.01 
 
 
730 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  28.24 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  28.24 
 
 
233 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  32 
 
 
229 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  28.57 
 
 
233 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
804 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 
217 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  32.51 
 
 
474 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.47 
 
 
240 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.11 
 
 
234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  35.89 
 
 
766 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  31.07 
 
 
724 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  32.51 
 
 
802 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  31.86 
 
 
724 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  27.65 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  30.24 
 
 
720 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  29.38 
 
 
759 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  33.49 
 
 
239 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 
232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  30.73 
 
 
720 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  30.24 
 
 
720 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  30.24 
 
 
720 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  31.25 
 
 
721 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  30.24 
 
 
720 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  30.24 
 
 
720 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  30.24 
 
 
720 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  30.24 
 
 
720 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  33.33 
 
 
745 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  29.41 
 
 
217 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.76 
 
 
720 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  31.55 
 
 
734 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  34.54 
 
 
753 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.37 
 
 
730 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.67 
 
 
492 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  34.3 
 
 
246 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 
453 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  34.76 
 
 
767 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.51 
 
 
722 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
746 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  31.07 
 
 
723 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  33.49 
 
 
667 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  33.85 
 
 
744 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
747 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  36.11 
 
 
736 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  30.54 
 
 
716 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  31.4 
 
 
786 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  32.14 
 
 
747 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  35.9 
 
 
484 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  34.38 
 
 
774 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  35.9 
 
 
722 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.02 
 
 
230 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.92 
 
 
472 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.02 
 
 
230 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  29.13 
 
 
723 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  32.49 
 
 
749 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  32.81 
 
 
744 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  29.1 
 
 
756 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  29.81 
 
 
221 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  32.29 
 
 
734 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  30.62 
 
 
726 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  32.2 
 
 
742 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.86 
 
 
575 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.6 
 
 
220 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  32.46 
 
 
750 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.13 
 
 
615 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  35.39 
 
 
775 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>