145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0228 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  739    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  30 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  26.65 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  28.06 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  28.06 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  25 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  29.46 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2386  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  22.78 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  22.79 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  25.08 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  23.06 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  25.08 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  23.04 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  23.19 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.85 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  22.4 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  22.8 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  25 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0947  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  23.82 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  24.12 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  22.56 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  25.17 
 
 		 520 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  28.09 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  28.09 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 311 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  27.22 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  23.75 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  23.75 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  24.92 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  23.24 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>