57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2620 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2620  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.866097  normal  0.0216756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  36.4 
 
 		 1914 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1714 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 		 782 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1313 aa  109  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1101 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.91 
 
 		 985 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1238 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1063 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1382  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  26.83 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1526 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 		 957 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.91 
 
 		 945 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2036  hypothetical protein  53.12 
 
 		 79 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.233414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  26.97 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1261 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 		 1295 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1596 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 		 725 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  29.86 
 
 		 834 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 817 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.95 
 
 		 991 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 809 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  27.83 
 
 		 694 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  25.61 
 
 		 999 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 816 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.34 
 
 		 740 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.13 
 
 		 807 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  23.74 
 
 		 799 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  25.44 
 
 		 992 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  20.72 
 
 		 689 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1025 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  28.43 
 
 		 1227 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  21.99 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 1071 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 		 1204 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 852 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1068 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 		 760 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 		 1198 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.75 
 
 		 1162 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 840 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 		 1424 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  21.82 
 
 		 621 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1162 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  26.85 
 
 		 768 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  22.46 
 
 		 1123 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.33 
 
 		 609 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  30.3 
 
 		 2327 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1119 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 649 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 910 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>