66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6738 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  82.97 
 
 
634 aa  1040    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  54.5 
 
 
631 aa  677    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  69.75 
 
 
633 aa  857    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  65.38 
 
 
637 aa  781    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.2 
 
 
612 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  65.65 
 
 
631 aa  809    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  65.38 
 
 
637 aa  761    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.62 
 
 
638 aa  748    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.94 
 
 
637 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  84.24 
 
 
635 aa  1036    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.32 
 
 
647 aa  710    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  65.43 
 
 
633 aa  783    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  93.35 
 
 
630 aa  1167    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.35 
 
 
640 aa  846    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  84.38 
 
 
636 aa  1040    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.57 
 
 
634 aa  843    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.44 
 
 
633 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.82 
 
 
644 aa  858    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  84.24 
 
 
635 aa  1036    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 
632 aa  1265    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  64.13 
 
 
633 aa  792    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.78 
 
 
633 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.02 
 
 
620 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  68.38 
 
 
633 aa  835    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.98 
 
 
632 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  70.53 
 
 
635 aa  869    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.87 
 
 
631 aa  857    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.41 
 
 
631 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  64.56 
 
 
631 aa  806    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  68.66 
 
 
645 aa  852    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.49 
 
 
633 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.67 
 
 
604 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  56.32 
 
 
607 aa  615  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  53.63 
 
 
626 aa  614  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  54.97 
 
 
624 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  53.46 
 
 
625 aa  608  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  54.75 
 
 
619 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.88 
 
 
622 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  54.75 
 
 
619 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  52.88 
 
 
619 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  52.5 
 
 
633 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  52.56 
 
 
622 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  35.52 
 
 
563 aa  280  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  36.15 
 
 
577 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  33.09 
 
 
577 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  34.51 
 
 
574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  35.25 
 
 
578 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  33.51 
 
 
610 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  41.9 
 
 
573 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  37.75 
 
 
573 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  29.37 
 
 
788 aa  95.1  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  32.33 
 
 
584 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 
634 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 
533 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  20.5 
 
 
572 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  24.73 
 
 
628 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  24.73 
 
 
628 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  26.83 
 
 
599 aa  51.2  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  25.88 
 
 
629 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4345  von Willebrand factor, type A  28.38 
 
 
802 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.961605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  23.12 
 
 
547 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  23.53 
 
 
601 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
615 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  23.12 
 
 
547 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  23.75 
 
 
584 aa  43.9  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>