160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2764 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 362 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  80 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  46.03 
 
 		 381 aa  305  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.22 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.22 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  44.63 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  42.64 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  47.4 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  42.42 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.22 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  43.22 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  41.55 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  43.22 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  43.22 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.37 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  39.01 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  45.09 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  40.66 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.06 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  43.19 
 
 		 365 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  39.55 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  42.44 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  44.82 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  42.04 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  44.51 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  43.11 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  40.9 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  40.19 
 
 		 365 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  38.41 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  37.58 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  36.53 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  38.41 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  37.58 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  43.31 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  40.18 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  34.57 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  39.48 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  37.82 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  34.6 
 
 		 354 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  35.22 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  36.7 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  28.37 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  39.74 
 
 		 155 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2833  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  25.79 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  23.92 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  24.75 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  24.75 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  24.75 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.75 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.75 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 325 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2658  twin-arginine translocation pathway signal  25.2 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  26 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  26.67 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 334 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.41 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>