49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2658 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2658  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 350 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2940  twin-arginine translocation pathway signal  24.3 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  23.57 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  24.81 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  25.86 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.09 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  24.73 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.26 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0793  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  24.45 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.295736  normal  0.158194 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.59 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  25 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  23.74 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1234  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  24.82 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  22.86 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1233  hypothetical protein  36.23 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>