More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2684 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  55.49 
 
 		 663 aa  702    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  53.34 
 
 		 663 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  57.01 
 
 		 667 aa  736    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  100 
 
 		 646 aa  1329    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  81.09 
 
 		 660 aa  1097    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  54.36 
 
 		 667 aa  701    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  52.8 
 
 		 669 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  81.25 
 
 		 660 aa  1098    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  51.61 
 
 		 673 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  81.25 
 
 		 660 aa  1099    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  56.92 
 
 		 670 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  50.31 
 
 		 663 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  81.15 
 
 		 660 aa  1096    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  51.38 
 
 		 666 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  55.47 
 
 		 648 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  50.48 
 
 		 650 aa  624  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  56.95 
 
 		 542 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  49.68 
 
 		 633 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  51.84 
 
 		 516 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  52.15 
 
 		 522 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  50.48 
 
 		 524 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  46.46 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  49.52 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  49.52 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  47.83 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  43.33 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  43.33 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  42.94 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  42.94 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  43.33 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  42.94 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  43.14 
 
 		 531 aa  429  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  42.35 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  43.53 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  42.94 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  43.33 
 
 		 531 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  43.33 
 
 		 531 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  42.38 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  43.33 
 
 		 531 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  43.33 
 
 		 531 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  48.84 
 
 		 433 aa  412  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  43.43 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  45.98 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  44.73 
 
 		 523 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  44.27 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  42.08 
 
 		 526 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  44.66 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  44.1 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  44.47 
 
 		 513 aa  379  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  42.7 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  44.1 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  44.27 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  40.88 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  42.7 
 
 		 554 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  42.52 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  39.69 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  43.5 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  41.52 
 
 		 542 aa  363  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  42.89 
 
 		 509 aa  359  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  39.73 
 
 		 539 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  38.64 
 
 		 530 aa  353  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  39.39 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  39.66 
 
 		 522 aa  349  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  39.58 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  38.18 
 
 		 520 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  38.18 
 
 		 520 aa  346  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  38.29 
 
 		 544 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  40.42 
 
 		 522 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  40.15 
 
 		 526 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  40.32 
 
 		 537 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  38.24 
 
 		 544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  40.39 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  37.64 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  38.89 
 
 		 523 aa  333  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  40.23 
 
 		 508 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  37.98 
 
 		 543 aa  320  7e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  36.6 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  28.83 
 
 		 448 aa  137  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  29.67 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.21 
 
 		 447 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  24.7 
 
 		 505 aa  99.4  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.38 
 
 		 216 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.28 
 
 		 269 aa  99  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  32.37 
 
 		 232 aa  97.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.33 
 
 		 252 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  26.04 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  25.05 
 
 		 561 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.34 
 
 		 235 aa  90.5  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.2 
 
 		 267 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.91 
 
 		 233 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.2 
 
 		 234 aa  87.4  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  24.95 
 
 		 519 aa  87.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.62 
 
 		 217 aa  87.4  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.34 
 
 		 272 aa  87  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.61 
 
 		 439 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  30.08 
 
 		 233 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  33.74 
 
 		 244 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.71 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  29.61 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.06 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>