294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2242 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  81.76 
 
 		 444 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  83.78 
 
 		 444 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  66.81 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  65.32 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  65.54 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  67.27 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  64.35 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  62.27 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  64.21 
 
 		 440 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  63.35 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  65.24 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  64.13 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  58.84 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  50.78 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  57.64 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  59.07 
 
 		 457 aa  345  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  54.09 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  43.8 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  53.04 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  46.5 
 
 		 307 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.59 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.81 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.18 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  28.36 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.05 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.71 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.85 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.73 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.74 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.1 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  19.85 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.55 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.55 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.55 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.26 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.33 
 
 		 1833 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.79 
 
 		 1876 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  25.93 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.33 
 
 		 1806 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.58 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.79 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.85 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  27.09 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.43 
 
 		 2720 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  24.23 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  27.27 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  19.73 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.59 
 
 		 1829 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  26.76 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  21.88 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.98 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.9 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  21.87 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  27.1 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.46 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  22.11 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>