More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4187 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  76.65 
 
 
259 aa  408  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  76.8 
 
 
260 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  74.52 
 
 
261 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  74.8 
 
 
268 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  76.31 
 
 
265 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  75.3 
 
 
260 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  75.71 
 
 
257 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  71.59 
 
 
264 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  73.39 
 
 
273 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  74.09 
 
 
258 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  74.09 
 
 
258 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  74.49 
 
 
258 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  74.8 
 
 
260 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  72.58 
 
 
259 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  71.37 
 
 
265 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  69.6 
 
 
266 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  70.33 
 
 
265 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  70.16 
 
 
265 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  68.95 
 
 
274 aa  350  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  69.76 
 
 
285 aa  349  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  67.32 
 
 
260 aa  343  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  68 
 
 
284 aa  343  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  65.18 
 
 
257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  68.4 
 
 
263 aa  332  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  69.05 
 
 
274 aa  331  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  68.24 
 
 
272 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  68.29 
 
 
263 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  67.57 
 
 
265 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  64.9 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  61.42 
 
 
257 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  63.04 
 
 
275 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  66.12 
 
 
266 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  54.37 
 
 
253 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  52.21 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  50.2 
 
 
271 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  49.8 
 
 
254 aa  254  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  51.84 
 
 
260 aa  251  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  48.63 
 
 
263 aa  248  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  50.39 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  48.57 
 
 
261 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.15 
 
 
261 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 
260 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.9 
 
 
257 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
254 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.7 
 
 
271 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  46.31 
 
 
313 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  44.08 
 
 
278 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.87 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.31 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  46.72 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  44.13 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.94 
 
 
244 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.53 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  47.18 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.58 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  44.71 
 
 
271 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 
258 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
250 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.46 
 
 
265 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.31 
 
 
254 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.67 
 
 
249 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  45.97 
 
 
261 aa  208  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  42.23 
 
 
265 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  50 
 
 
269 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
247 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  44.9 
 
 
269 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  43.92 
 
 
259 aa  205  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  46.31 
 
 
257 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
283 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.94 
 
 
276 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  41.18 
 
 
282 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 
265 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.28 
 
 
265 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  42.06 
 
 
259 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
278 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  42.97 
 
 
262 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
275 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  43.72 
 
 
247 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  45 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.84 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  41.43 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
259 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  41.2 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
264 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41 
 
 
278 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  41.53 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  42.8 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.35 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  46.02 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.76 
 
 
273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  41.27 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>