More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2454 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  100 
 
 
394 aa  816    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1645  hippurate hydrolase  68.96 
 
 
368 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2199  amidohydrolase  56.81 
 
 
395 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0219  peptidase M20D, amidohydrolase  54.29 
 
 
390 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4114  amidohydrolase  53.54 
 
 
385 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  43.75 
 
 
384 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  40 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.84 
 
 
399 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.04 
 
 
393 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  42.37 
 
 
425 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.84 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.24 
 
 
380 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.57 
 
 
403 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.46 
 
 
387 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  41.84 
 
 
388 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  41.64 
 
 
385 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  41.08 
 
 
395 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.65 
 
 
389 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.58 
 
 
397 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  40.11 
 
 
401 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  40.11 
 
 
401 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  39.89 
 
 
385 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  40.44 
 
 
402 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  41.08 
 
 
395 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  40.54 
 
 
387 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  41.53 
 
 
397 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  41.85 
 
 
397 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
397 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.99 
 
 
397 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  40.37 
 
 
404 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  40.54 
 
 
395 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  40 
 
 
407 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  40.54 
 
 
395 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  40.54 
 
 
395 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  38.75 
 
 
399 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 
398 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  41.11 
 
 
389 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  40.54 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  39.27 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  38.5 
 
 
396 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.24 
 
 
387 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  38.5 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.59 
 
 
379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  39.89 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  38.5 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.34 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  38.96 
 
 
415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.5 
 
 
396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.34 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.34 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.34 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.84 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  38.5 
 
 
396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  38.5 
 
 
396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  40.49 
 
 
392 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  38.5 
 
 
396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  38.5 
 
 
396 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  38.74 
 
 
424 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  38.62 
 
 
408 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  40.43 
 
 
387 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  40 
 
 
387 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  39.06 
 
 
395 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.41 
 
 
390 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  40.43 
 
 
386 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  38.86 
 
 
408 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  39.58 
 
 
401 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  40.44 
 
 
395 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39.3 
 
 
406 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  36.46 
 
 
383 aa  249  5e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  38.56 
 
 
385 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  38.85 
 
 
397 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  39.01 
 
 
423 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  39.84 
 
 
402 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  38.61 
 
 
387 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  41.9 
 
 
396 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  38.4 
 
 
408 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  39.62 
 
 
396 aa  249  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  37.8 
 
 
387 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  36.19 
 
 
383 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  36.02 
 
 
383 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  40.16 
 
 
388 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  38.99 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  38.79 
 
 
403 aa  246  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  38.75 
 
 
388 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  40.5 
 
 
405 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  39.47 
 
 
387 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.8 
 
 
387 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  40.34 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  40.8 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  38.65 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  38.07 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  38.86 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.78 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  40.34 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  40.8 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  40.8 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  38.52 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  38.87 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  37 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  37 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>