More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0362 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  100 
 
 		 423 aa  871    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  43.52 
 
 		 456 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  43.08 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  43.41 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  41.88 
 
 		 463 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  44.95 
 
 		 440 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  41.88 
 
 		 449 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  40.68 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  40.84 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  40.42 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  40.58 
 
 		 447 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  39.9 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  41.53 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  40.11 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  41.67 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  41.3 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  40.33 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  43.85 
 
 		 458 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  41.56 
 
 		 476 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  41.73 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  44.65 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  41.3 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  39.47 
 
 		 450 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  41.47 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  40.94 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  41.04 
 
 		 616 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  41.04 
 
 		 616 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  41.04 
 
 		 616 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  41.04 
 
 		 472 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  41.04 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  41.04 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  41.04 
 
 		 472 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  43.85 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  43.33 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  42.31 
 
 		 458 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  42.31 
 
 		 458 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  42.15 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  42.86 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  42.82 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  42.82 
 
 		 458 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  37.11 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  37.28 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  37.79 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  36.75 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  37.01 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  37.76 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  39.38 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  36.27 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  37.4 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  37.5 
 
 		 462 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  36.01 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  36.22 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  35.05 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  39.64 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2598  amidase  37.1 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  35.43 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  35.66 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  35.55 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  37.27 
 
 		 448 aa  196  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  37.8 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  34.78 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  35.98 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  36.25 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  34.91 
 
 		 443 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  33.51 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  38.58 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  36.98 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  34.02 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  35.37 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  32.29 
 
 		 451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  32.55 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2027  Amidase  33.85 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  31.2 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  34.22 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  35.23 
 
 		 441 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  33.88 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  33.92 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  35.5 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  32.49 
 
 		 471 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0327  amidase  34.97 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  32.31 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  35.18 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  35.18 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  35.18 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  35.18 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  35.18 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  35.18 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  34.92 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0827  Amidase  31.74 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0223449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.41 
 
 		 485 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  33.84 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  30.05 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  29.18 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.94 
 
 		 467 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.1 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.92 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  29.12 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  40.71 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  45.05 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7392  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.76 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>