211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0157 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 311 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  57.04 
 
 		 296 aa  348  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  54.3 
 
 		 302 aa  325  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  47.57 
 
 		 292 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2700  RimK domain protein ATP-grasp  44.83 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.734268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  25 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  24.15 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.83 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  27.57 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.23 
 
 		 329 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  27.1 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.73 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.34 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  25.54 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.92 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  26.17 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  24.75 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.97 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.64 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  23.18 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.2 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  24.02 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.13 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  22.89 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.24 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  22.81 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.48 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  22.82 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  23.94 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  23.47 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  23.72 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  24.15 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  23.94 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  23.47 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  23.47 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.47 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  23.47 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  24.76 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  23.26 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.12 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.64 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.26 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.5 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.71 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.51 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.99 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.22 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.57 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.4 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.57 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.83 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.32 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  22.07 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  22.83 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  22.92 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.63 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  20.64 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  24.06 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.83 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  21.02 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  20.6 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  20.6 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  20.6 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  21.1 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  21.1 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.04 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.89 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  21.18 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.21 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  24.04 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.27 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  25.11 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.32 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  21.33 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.55 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  22.07 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  22.7 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.94 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.97 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  20.6 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.73 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  21.26 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.5 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  23.97 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.97 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.33 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.86 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.07 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  22.41 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  22.92 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.75 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.78 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  23.94 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  20.93 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.4 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>