71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2198 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  100 
 
 		 720 aa  1430    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  41.37 
 
 		 720 aa  551  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  33.38 
 
 		 715 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  33.85 
 
 		 715 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  34.27 
 
 		 715 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  33.73 
 
 		 714 aa  369  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  31.22 
 
 		 715 aa  344  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  31.17 
 
 		 721 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  31.54 
 
 		 711 aa  313  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  31.04 
 
 		 741 aa  220  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  26.18 
 
 		 719 aa  177  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  27.02 
 
 		 688 aa  171  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  27.89 
 
 		 709 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  27.29 
 
 		 702 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  24.25 
 
 		 714 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  26.63 
 
 		 709 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  28.26 
 
 		 696 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  28.17 
 
 		 709 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  25.96 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  25.13 
 
 		 703 aa  146  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  25.2 
 
 		 699 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  26.64 
 
 		 707 aa  142  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  30.79 
 
 		 720 aa  140  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  27.3 
 
 		 697 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  30.18 
 
 		 736 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  25.04 
 
 		 701 aa  137  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  28.41 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  25.08 
 
 		 698 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  26.32 
 
 		 701 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  31.06 
 
 		 367 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 1124 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  40.69 
 
 		 1177 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  33.49 
 
 		 1171 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  33.8 
 
 		 838 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  32.2 
 
 		 238 aa  73.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  30.3 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  33.1 
 
 		 825 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  32.39 
 
 		 847 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  32.39 
 
 		 847 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  32.39 
 
 		 844 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  31.69 
 
 		 824 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 948 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  30 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  28.37 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  27.68 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  24.86 
 
 		 350 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  28.95 
 
 		 497 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  34.4 
 
 		 812 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 367 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24.06 
 
 		 357 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  30 
 
 		 224 aa  47.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2431  peptidase M50  29.3 
 
 		 410 aa  47.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0730109  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  27.33 
 
 		 224 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0907  peptidase M50  29.29 
 
 		 286 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  27.45 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1862  hypothetical protein  22.26 
 
 		 865 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  27.33 
 
 		 224 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1836  hypothetical protein  22.26 
 
 		 865 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  27.45 
 
 		 224 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  27.45 
 
 		 224 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  30.38 
 
 		 761 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.69 
 
 		 440 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 		 380 aa  45.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.87 
 
 		 441 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 		 352 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  26.8 
 
 		 224 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  29.31 
 
 		 360 aa  44.3  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  26.8 
 
 		 224 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  26.8 
 
 		 224 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  26.32 
 
 		 224 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5506  hypothetical protein  29.25 
 
 		 224 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>