101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1368 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  99.31 
 
 		 503 aa  302  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1368  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  46.98 
 
 		 495 aa  137  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  46.98 
 
 		 495 aa  137  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 495 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  43.62 
 
 		 495 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 549 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  48.85 
 
 		 503 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 490 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  47.69 
 
 		 560 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  47.69 
 
 		 560 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  48.8 
 
 		 568 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3460  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  40.85 
 
 		 202 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  40.85 
 
 		 490 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 504 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 504 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 504 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 458 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 489 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 311 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 489 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 489 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 515 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 544 aa  114  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  48.87 
 
 		 505 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  38.85 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  37.68 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  37.68 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  37.68 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  41.41 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 566 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 490 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  44.63 
 
 		 589 aa  105  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 556 aa  106  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  44 
 
 		 565 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  42.4 
 
 		 561 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  42.15 
 
 		 634 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 568 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  43.8 
 
 		 338 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  43.8 
 
 		 338 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 		 571 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  40.5 
 
 		 635 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.09 
 
 		 437 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.02 
 
 		 607 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.02 
 
 		 607 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.02 
 
 		 607 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.02 
 
 		 607 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.16 
 
 		 596 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  43.86 
 
 		 492 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 		 576 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 		 576 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 		 592 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 		 576 aa  90.9  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0469  group II intron, maturase-specific  36.76 
 
 		 189 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  38.98 
 
 		 635 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  36.43 
 
 		 569 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_002978  WD0043  reverse transcriptase, interruption-C  40.38 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 554 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 585 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  37.62 
 
 		 449 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 585 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  34.15 
 
 		 585 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 627 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 627 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  33.59 
 
 		 666 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.29 
 
 		 661 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.72 
 
 		 502 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  40.82 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  38.79 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.83 
 
 		 548 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.83 
 
 		 548 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 553 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 490 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 490 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 490 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.83 
 
 		 548 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.83 
 
 		 548 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.83 
 
 		 548 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  33.83 
 
 		 548 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.75 
 
 		 648 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.75 
 
 		 648 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  35.59 
 
 		 490 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  29.63 
 
 		 602 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0181  HNH endonuclease family protein  34.78 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 488 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.84 
 
 		 434 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.70829 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  26.53 
 
 		 587 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>