52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0181 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0181  HNH endonuclease family protein  100 
 
 
168 aa  345  2e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0043  reverse transcriptase, interruption-C  91.37 
 
 
228 aa  268  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.53 
 
 
596 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  46.09 
 
 
338 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.38 
 
 
607 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.38 
 
 
607 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.38 
 
 
607 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  43.38 
 
 
607 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  46.09 
 
 
338 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  43.84 
 
 
635 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 
627 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 
627 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 
589 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  41.77 
 
 
634 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  45.38 
 
 
635 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.11 
 
 
661 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 
648 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 
648 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  32.84 
 
 
666 aa  77.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  42.16 
 
 
554 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0469  group II intron, maturase-specific  43 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  32.41 
 
 
515 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 
549 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 
560 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  29.25 
 
 
560 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 
568 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  29.79 
 
 
592 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  29.79 
 
 
576 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 
495 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 
495 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  28.67 
 
 
556 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 
568 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  29.08 
 
 
576 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  29.08 
 
 
576 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  26.67 
 
 
561 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.56 
 
 
502 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  25.87 
 
 
565 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 
503 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1368  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  34.78 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
490 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
490 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
490 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  30.56 
 
 
503 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 
490 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  23.89 
 
 
571 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  32.1 
 
 
490 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  32.5 
 
 
490 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  32.5 
 
 
490 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  32.5 
 
 
490 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  29.55 
 
 
490 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  29.58 
 
 
495 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  29.58 
 
 
495 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>