More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1553 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1553  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.575678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0366  ribulose-phosphate 3-epimerase  98.17 
 
 
219 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.925809  normal  0.0125175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0470  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  95.43 
 
 
219 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0944397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0439  ribulose-phosphate 3-epimerase  75 
 
 
218 aa  338  5e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1504  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
219 aa  308  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0207643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.48 
 
 
214 aa  208  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
214 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.26 
 
 
214 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.69 
 
 
218 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.13 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.83 
 
 
218 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.91 
 
 
219 aa  194  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 
221 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.18 
 
 
221 aa  194  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.75 
 
 
231 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
224 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
222 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
221 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
221 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
221 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.87 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.32 
 
 
221 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.32 
 
 
221 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.58 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.23 
 
 
234 aa  181  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.5 
 
 
229 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
224 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.47 
 
 
224 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.59 
 
 
247 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
224 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
235 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.45 
 
 
220 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.45 
 
 
220 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 
224 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
222 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 
228 aa  175  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
236 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 
224 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
221 aa  175  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
214 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.81 
 
 
223 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
238 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
214 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.06 
 
 
218 aa  174  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.4 
 
 
219 aa  174  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
221 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1014  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1434  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.83 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1116  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.22 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
235 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.06 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
234 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
234 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.12 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
235 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.85 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.22 
 
 
220 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  38.89 
 
 
265 aa  170  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 
225 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.86 
 
 
219 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.93 
 
 
225 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2830  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 
218 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
225 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
241 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1725  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
220 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0183458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1667  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
226 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.25106e-16 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.25 
 
 
223 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.4 
 
 
230 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.47 
 
 
217 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 
228 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18110  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
220 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.562639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
228 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.07 
 
 
218 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.51 
 
 
221 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
225 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
225 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
225 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
225 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 
225 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.47 
 
 
225 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>