More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1808 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  90.33 
 
 		 269 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  85.13 
 
 		 269 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  66.42 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  55.13 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.53 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.03 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.86 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.62 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.92 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.1 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.21 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.37 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.06 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.15 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.55 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.62 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.15 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.92 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.89 
 
 		 312 aa  89  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.88 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  28.91 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.62 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  25.93 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  29.1 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  30.59 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  28.19 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.56 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.5 
 
 		 309 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.46 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  28.08 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  28.86 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.31 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  28.73 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.57 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.45 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  27.45 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.71 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.42 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  27.45 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  27.45 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  27.45 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.4 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  31.25 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.56 
 
 		 330 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.61 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  25.17 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  25.17 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  27.49 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  28.85 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  28.85 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  25.87 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.89 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  27.14 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.89 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.51 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.7 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.36 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  27.7 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.67 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  27.7 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  26.09 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  27.7 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  28.14 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  28.46 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.89 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  28.06 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  27.24 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  25.9 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  25.9 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.67 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.68 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  24.37 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.81 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  27.46 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  27.24 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  26.02 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25.98 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  26.15 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  25.37 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  24.56 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  22.61 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.83 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.66 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.86 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  24.63 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.8 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.9 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  25.8 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  25.8 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  25.8 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>