More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1410 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1410  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1266  tyrosyl-tRNA synthetase  97.41 
 
 
309 aa  617  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0690  tyrosyl-tRNA synthetase  97.08 
 
 
311 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.118103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1276  tyrosyl-tRNA synthetase  84.74 
 
 
319 aa  548  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0194  tyrosyl-tRNA synthetase  75 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0360156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1048  tyrosyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
325 aa  345  8e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0795852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1463  tyrosyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
317 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.056145  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2791  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0439459  normal  0.169169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2498  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1745  tyrosyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
317 aa  333  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2463  tyrosyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
313 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00510009  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2455  tyrosyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
313 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1734  tyrosyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
317 aa  319  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.446224  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1080  tyrosyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2672  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
331 aa  278  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2505  tyrosyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
328 aa  272  6e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.40451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
338 aa  259  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2529  tyrosyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
345 aa  255  7e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0676026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2565  tyrosyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
345 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134305 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2152  tyrosyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000510287  hitchhiker  0.000433253 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
361 aa  199  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0791  tyrosyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1751  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
348 aa  195  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2108  tyrosyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
314 aa  191  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.253913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0892  tyrosyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
336 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01310  phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase, putative  34.56 
 
 
824 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74631  tyrosyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
404 aa  186  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 
372 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2062  tyrosyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
372 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2290  tyrosyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
372 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15823  predicted protein  35.71 
 
 
349 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.263243  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
372 aa  159  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1659  tyrosyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
388 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.661585  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00057  tyrosyl-tRNA synthetase, putative (Eurofung)  31.13 
 
 
397 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.857416 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45368  predicted protein  28.91 
 
 
791 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
407 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1546  tyrosyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
410 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.211898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 
406 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0637  tyrosyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
392 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2221  tyrosyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0568  tyrosyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
405 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.74175  normal  0.29501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2269  tyrosyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0861  tyrosyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 
413 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1970  tyrosyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 
403 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.362658  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
395 aa  89  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
398 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
405 aa  86.7  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1808  tyrosyl-tRNA synthetase  25.15 
 
 
405 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  28.27 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0706  tyrosyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1161  tyrosyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
398 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0814  tyrosyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000175629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1468  tyrosyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
400 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
400 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
413 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  26.83 
 
 
403 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2197  tyrosyl-tRNA synthetase  24.85 
 
 
414 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0747984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3371  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0436  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00177319  normal  0.0465602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0469  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.000000000169724  decreased coverage  0.000126716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4767  tyrosyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000195797  normal  0.701844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3412  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
435 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08560  tyrosyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0100825  decreased coverage  0.000000000888942 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0140  tyrosyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.485656  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0720  tyrosyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0528  tyrosyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.445418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>