More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1169 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 858 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 		 871 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  43.8 
 
 		 862 aa  675    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 		 870 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 		 897 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  55.24 
 
 		 903 aa  898    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 		 932 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 869 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 881 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  49.5 
 
 		 900 aa  848    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 		 869 aa  726    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 867 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 864 aa  1766    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 870 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 		 828 aa  700    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 872 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.91 
 
 		 858 aa  648    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 873 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  44.16 
 
 		 863 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 868 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 868 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  54.94 
 
 		 892 aa  946    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 872 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  53.52 
 
 		 874 aa  882    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 		 869 aa  640    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  49.37 
 
 		 887 aa  843    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 882 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  53.77 
 
 		 872 aa  889    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.52 
 
 		 898 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 		 910 aa  679    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 		 910 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 863 aa  690    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.52 
 
 		 859 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.8 
 
 		 896 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  45.79 
 
 		 857 aa  727    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 868 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 853 aa  633  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 		 891 aa  634  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 872 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 880 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 865 aa  632  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  42.98 
 
 		 858 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  37.96 
 
 		 873 aa  624  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 904 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 870 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 857 aa  623  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 895 aa  625  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 890 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 881 aa  619  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 863 aa  621  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 851 aa  622  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 		 872 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 892 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 894 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 894 aa  617  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 860 aa  619  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 890 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 890 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 868 aa  614  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 892 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 889 aa  614  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.76 
 
 		 860 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 		 864 aa  609  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 		 903 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 		 882 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  38.29 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 887 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 856 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 878 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 854 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 871 aa  601  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 905 aa  601  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 856 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 872 aa  602  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 		 855 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 851 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 856 aa  598  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 853 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 862 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 850 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 884 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 884 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 855 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  39.57 
 
 		 863 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 854 aa  594  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 927 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 861 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 		 928 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 861 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 		 837 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>