More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5541 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  972    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  62.34 
 
 
476 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  53.48 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  32.82 
 
 
462 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  34 
 
 
448 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.21 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  33.79 
 
 
454 aa  201  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  32.29 
 
 
451 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  32.65 
 
 
436 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  32.64 
 
 
574 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  32.14 
 
 
447 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  32.62 
 
 
437 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  33.86 
 
 
440 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  31.85 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  31.66 
 
 
438 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  31.65 
 
 
438 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  30.75 
 
 
445 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  30.52 
 
 
445 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  30.52 
 
 
445 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  32.27 
 
 
455 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  33.11 
 
 
450 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  31.7 
 
 
445 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  34.21 
 
 
434 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  32.06 
 
 
443 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  42.25 
 
 
470 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  28.26 
 
 
461 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  32.6 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  32.05 
 
 
499 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  31.81 
 
 
448 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  31.47 
 
 
481 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  32.97 
 
 
445 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  29.91 
 
 
445 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  31.86 
 
 
452 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  29.74 
 
 
455 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  29.58 
 
 
456 aa  160  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  29.32 
 
 
456 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  34.05 
 
 
446 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  29.24 
 
 
453 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  30.45 
 
 
470 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  33.96 
 
 
433 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  33.54 
 
 
432 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  31.65 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  33.96 
 
 
433 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  33.66 
 
 
452 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  32.67 
 
 
453 aa  154  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  30.05 
 
 
456 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.52 
 
 
454 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  33.9 
 
 
475 aa  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  28.27 
 
 
453 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  29.08 
 
 
455 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  34.92 
 
 
454 aa  147  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  29.1 
 
 
440 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  28.41 
 
 
629 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  32.82 
 
 
485 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  32.53 
 
 
483 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  29.94 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  30.48 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  29.64 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  25.94 
 
 
555 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  29.35 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  34.77 
 
 
619 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  30.45 
 
 
438 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  32.66 
 
 
767 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  33.12 
 
 
451 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.12 
 
 
451 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  34.29 
 
 
556 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  32.57 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  32.03 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  35.64 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  29.35 
 
 
469 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  31.76 
 
 
574 aa  133  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  30.18 
 
 
457 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  30.34 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  36.43 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  28.9 
 
 
574 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  29.3 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  30.65 
 
 
480 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  32.3 
 
 
556 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.46 
 
 
558 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  27.76 
 
 
576 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.65 
 
 
558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1325  hypothetical protein  32.46 
 
 
619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  30 
 
 
583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  30.37 
 
 
620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  28.79 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21981  hypothetical protein  32.09 
 
 
619 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.544475  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  29.78 
 
 
566 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  31.62 
 
 
563 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  32.96 
 
 
458 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  28.66 
 
 
440 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  29.81 
 
 
440 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  30.36 
 
 
670 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  31.65 
 
 
560 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.97 
 
 
441 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2235  hypothetical protein  30.75 
 
 
666 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00408279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  32 
 
 
689 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  32.3 
 
 
299 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>