86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2255 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1158    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  70.11 
 
 		 542 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  64.27 
 
 		 540 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1158    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  69.19 
 
 		 540 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1158    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  51.85 
 
 		 531 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  46.63 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  46.36 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  46.21 
 
 		 577 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  46.22 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  46.69 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  42.78 
 
 		 548 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  44.57 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  43.46 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  43.45 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  43.27 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  43.7 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  40.03 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  41.11 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  38.29 
 
 		 636 aa  349  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1225  hypothetical protein  39.29 
 
 		 568 aa  306  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  26.63 
 
 		 678 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.8 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  22.69 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  26.04 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  25.23 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  24.04 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  24.04 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  24.83 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  25.7 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  24.73 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  24.74 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  24.51 
 
 		 633 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  26.02 
 
 		 714 aa  70.5  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2702  alkaline phosphatase  24.46 
 
 		 460 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  25.34 
 
 		 628 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  24.59 
 
 		 577 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3232  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.12 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0910  alkaline phosphatase  25.08 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  22.73 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0884  alkaline phosphatase  25.99 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  23.53 
 
 		 619 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  24.44 
 
 		 616 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  23.47 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  23.53 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  25.32 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  20.83 
 
 		 616 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2438  hypothetical protein  22.1 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  22.66 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.39 
 
 		 469 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  24.62 
 
 		 616 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  22.77 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  25.59 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  23.91 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  24.61 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  27.24 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  26.42 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  24.3 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  24.76 
 
 		 655 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  25.53 
 
 		 668 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  25.82 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 773 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  23.19 
 
 		 706 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  24.44 
 
 		 648 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  26.67 
 
 		 659 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0424  hypothetical protein  24.42 
 
 		 473 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.469457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  23.53 
 
 		 621 aa  53.9  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  37.29 
 
 		 708 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  23.56 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2288  hypothetical protein  26.32 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.331255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2132  hypothetical protein  26.32 
 
 		 534 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.509777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  22.03 
 
 		 521 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  20.92 
 
 		 622 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  24.19 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  27.71 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 		 527 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  25.2 
 
 		 517 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  25.91 
 
 		 520 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  24.07 
 
 		 513 aa  44.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 520 aa  44.3  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00050  conserved hypothetical protein  22.14 
 
 		 558 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.365734  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.25 
 
 		 540 aa  43.9  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4509  hypothetical protein  22.51 
 
 		 529 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  32.56 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  27.91 
 
 		 520 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>