More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3186 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3186  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1787  ABC transporter related  46.15 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0133  hypothetical protein  50.79 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1013  ABC transporter related  41.33 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1646  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  33.17 
 
 		 451 aa  92.8  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  34.97 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.58 
 
 		 310 aa  89.4  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  35.5 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  36.56 
 
 		 345 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.44 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  31.89 
 
 		 371 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  30.1 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.56 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  33.86 
 
 		 325 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.83 
 
 		 277 aa  85.5  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  30.65 
 
 		 367 aa  85.1  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  30.65 
 
 		 367 aa  85.1  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  31.06 
 
 		 370 aa  85.1  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1963  ABC transporter, ATPase subunit  32.35 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  30.61 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  30.46 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  27.23 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  27.31 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  30.92 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  30.23 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  29.08 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  31.5 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.24 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  33.17 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  28.51 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  30.23 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  34.5 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  32.8 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  30.73 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.33 
 
 		 501 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  29.13 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  32.23 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  32.53 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  29.29 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  29.61 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1020  ABC transporter related  39.16 
 
 		 352 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  32.22 
 
 		 353 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  33.76 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 		 355 aa  81.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  31.87 
 
 		 966 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  29.65 
 
 		 330 aa  81.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  30.85 
 
 		 397 aa  81.6  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_002950  PG1760  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.55 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  30.66 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3834  ABC transporter related  29.44 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  32.29 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  30.39 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01421  ABC transporter ATP-binding protein  28.49 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  30.11 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  30.87 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  31.31 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  32.5 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  30.69 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  28.93 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  28.84 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  30.21 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  30.32 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  31.88 
 
 		 960 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  31.94 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 568 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1187  ABC transporter related  29.9 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  30.73 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0315  ATPase  30.85 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  36.24 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  30.41 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  30.14 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  32.79 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  31.89 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  32.28 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  32.24 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  29.05 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  29.77 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.84 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  31.11 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  31.68 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  30 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  33.52 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  29.69 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  29.57 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2451  ABC transporter related  28.57 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0268  ABC transporter related  29.03 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.15 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  30.41 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>