More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2277 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  965    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.56 
 
 
480 aa  475  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.41 
 
 
467 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.5 
 
 
450 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  47.54 
 
 
458 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.22 
 
 
462 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  36.65 
 
 
481 aa  280  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.08 
 
 
504 aa  271  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.08 
 
 
514 aa  271  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.08 
 
 
483 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.27 
 
 
507 aa  263  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  38.38 
 
 
502 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.81 
 
 
478 aa  250  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.79 
 
 
482 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.12 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 
504 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.97 
 
 
520 aa  232  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.45 
 
 
504 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.39 
 
 
542 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.79 
 
 
501 aa  227  4e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
498 aa  219  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.81 
 
 
503 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 
505 aa  206  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.02 
 
 
477 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 
493 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.78 
 
 
510 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.99 
 
 
500 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.63 
 
 
519 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.15 
 
 
513 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.49 
 
 
524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.42 
 
 
501 aa  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.31 
 
 
512 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.96 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.1 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.76 
 
 
533 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.33 
 
 
500 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  31.14 
 
 
462 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.06 
 
 
530 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.86 
 
 
498 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  31.37 
 
 
514 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  31.37 
 
 
514 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  31.37 
 
 
514 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.7 
 
 
510 aa  143  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.1 
 
 
517 aa  144  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  31.37 
 
 
514 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 
520 aa  143  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.42 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.8 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  31.18 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  32.16 
 
 
514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.11 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.46 
 
 
502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 
556 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.58 
 
 
499 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.12 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.14 
 
 
499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.62 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.62 
 
 
515 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.33 
 
 
504 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.76 
 
 
528 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.98 
 
 
515 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 
515 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  30.65 
 
 
524 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.98 
 
 
515 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.33 
 
 
504 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.42 
 
 
510 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  29.22 
 
 
515 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.12 
 
 
504 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  31.42 
 
 
513 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  31.8 
 
 
510 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.98 
 
 
499 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.09 
 
 
533 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.12 
 
 
496 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.84 
 
 
504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.4 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.42 
 
 
510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.82 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 
494 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 
494 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.58 
 
 
499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  29.46 
 
 
502 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.6 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.95 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.49 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  29.88 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.08 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  31.38 
 
 
522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.36 
 
 
492 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.88 
 
 
516 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.99 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  29.8 
 
 
496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.85 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.19 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.2 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 
499 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30.6 
 
 
524 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.05 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.98 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  31.31 
 
 
519 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>