More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2108 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  100 
 
 		 434 aa  900    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  67.76 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  56.47 
 
 		 587 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  52.34 
 
 		 574 aa  503  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  50.93 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  46 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  46.3 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  46.06 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  45.5 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  45.52 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  45.39 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  45.68 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  45.24 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  46.17 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  42.92 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  44.16 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  44.01 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  43.16 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  43.15 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.5 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.23 
 
 		 443 aa  349  4e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.23 
 
 		 442 aa  348  7e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.68 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  41.47 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  40.6 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.44 
 
 		 470 aa  335  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.48 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 		 447 aa  333  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.18 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.42 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  33.41 
 
 		 406 aa  243  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.81 
 
 		 414 aa  239  8e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.24 
 
 		 415 aa  220  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  25.4 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.86 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  25.68 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  22.81 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.6 
 
 		 668 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.81 
 
 		 662 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 980 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.17 
 
 		 980 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.97 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.61 
 
 		 986 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.17 
 
 		 978 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  27.17 
 
 		 978 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  26.89 
 
 		 978 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.17 
 
 		 978 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.17 
 
 		 978 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.28 
 
 		 978 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.65 
 
 		 978 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  26.09 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.98 
 
 		 994 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.65 
 
 		 978 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.28 
 
 		 978 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.8 
 
 		 688 aa  83.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.92 
 
 		 987 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.96 
 
 		 716 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  26.54 
 
 		 950 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.2 
 
 		 674 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.97 
 
 		 924 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.29 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.85 
 
 		 973 aa  79.7  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 950 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 950 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 987 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 950 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 		 950 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.01 
 
 		 687 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  26.26 
 
 		 950 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 716 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.3 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.04 
 
 		 674 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.69 
 
 		 716 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.47 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  25.98 
 
 		 950 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 		 979 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  26.05 
 
 		 715 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.05 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.83 
 
 		 979 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.05 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  26.05 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  26.72 
 
 		 983 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  26.05 
 
 		 715 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  26.05 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.14 
 
 		 949 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.75 
 
 		 674 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.96 
 
 		 716 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.28 
 
 		 924 aa  76.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.21 
 
 		 987 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 949 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 973 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.09 
 
 		 901 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 		 949 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.61 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.32 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 		 949 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  25.49 
 
 		 715 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  25.49 
 
 		 715 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>