120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0256 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  100 
 
 
300 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0638  aldose 1-epimerase  90 
 
 
300 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  61 
 
 
300 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  60.67 
 
 
300 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  60.67 
 
 
300 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  50.78 
 
 
327 aa  298  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1483  Aldose 1-epimerase  35.6 
 
 
313 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114405  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  30.68 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  26.07 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  24.22 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  24.22 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.51 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  23.88 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.9 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  22.65 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.74 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  26.2 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  29.47 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  26.86 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  29.12 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3306  aldose 1-epimerase  22.11 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  25.6 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  26.03 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  28.91 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  25.59 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  27.63 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  23.62 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  24.4 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  23 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  23.17 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  25.66 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  23.17 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  26.38 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 
371 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  29.21 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  29.21 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
263 aa  52.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4246  aldose 1-epimerase  23.51 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1199  aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.21 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  26.4 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1165  aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  28.68 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  28.68 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  25.2 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  24.51 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  24.51 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  29.53 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  24.51 
 
 
357 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  24.51 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  24.51 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.38 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  21.38 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  28.03 
 
 
399 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  25.64 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  27.48 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  22.03 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1183  aldose 1-epimerase  24.3 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  normal  0.174259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  20.85 
 
 
299 aa  49.3  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  28.57 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  27.35 
 
 
296 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  29.13 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.56 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  24.58 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  27.06 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  26.95 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  25.1 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  24.36 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  24.11 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  24.11 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  24.09 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  21.58 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  25 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  22.48 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  27.22 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 
357 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  22.71 
 
 
290 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  22.75 
 
 
311 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  27.5 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  26.82 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  26.36 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  26.71 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  29.41 
 
 
311 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.16 
 
 
276 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  22.92 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  22.34 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  26.87 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  22.53 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  25.29 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  21.85 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  21.85 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  24.82 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  26.95 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  21.13 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>