More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1361 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  100 
 
 
389 aa  791    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  56.99 
 
 
396 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  59.66 
 
 
396 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  58.99 
 
 
397 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.66 
 
 
400 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  58.86 
 
 
399 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.34 
 
 
399 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.34 
 
 
399 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.34 
 
 
399 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  58.29 
 
 
400 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.34 
 
 
399 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  58 
 
 
395 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  58.29 
 
 
400 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  56.78 
 
 
399 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  56.78 
 
 
399 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  56.78 
 
 
399 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  56.94 
 
 
395 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.64 
 
 
393 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.1 
 
 
393 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.36 
 
 
384 aa  288  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  44.6 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 
469 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.48 
 
 
423 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  45.68 
 
 
398 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.12 
 
 
424 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  40.96 
 
 
430 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  46.59 
 
 
415 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.8 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  42 
 
 
396 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  41.8 
 
 
391 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  41.71 
 
 
391 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  42.11 
 
 
428 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  42.29 
 
 
396 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  42.33 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  42.77 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  42.66 
 
 
434 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  42.97 
 
 
404 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.65 
 
 
436 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  41.6 
 
 
433 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  38.94 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.62 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  42.26 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  38.83 
 
 
418 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  38.83 
 
 
418 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  39.08 
 
 
418 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  40.33 
 
 
423 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  43.65 
 
 
430 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  38.96 
 
 
397 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  38.2 
 
 
405 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 
395 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  37.57 
 
 
425 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  39.17 
 
 
387 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.84 
 
 
422 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  41.98 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  39.28 
 
 
405 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  38.59 
 
 
387 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  38.5 
 
 
386 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  39.04 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.51 
 
 
397 aa  235  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  40.79 
 
 
409 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  37.14 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  38.32 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.87 
 
 
385 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  36.87 
 
 
385 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  36.87 
 
 
385 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 
381 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  36.87 
 
 
385 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  41.09 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  36.94 
 
 
385 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  37.37 
 
 
385 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  37.37 
 
 
385 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  37.37 
 
 
385 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  37.96 
 
 
379 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  39.05 
 
 
408 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 
395 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  37.24 
 
 
388 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  38.68 
 
 
387 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  36.39 
 
 
385 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  36.6 
 
 
385 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  37.24 
 
 
395 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  37.26 
 
 
409 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  36.99 
 
 
397 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  36.6 
 
 
385 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.99 
 
 
397 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  36.99 
 
 
397 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  38.92 
 
 
386 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  36.99 
 
 
397 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 
397 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.47 
 
 
396 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  36.6 
 
 
385 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 
380 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  36.99 
 
 
397 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.26 
 
 
410 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  36.99 
 
 
409 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  37.25 
 
 
377 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  39.54 
 
 
412 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  39.02 
 
 
420 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  36.71 
 
 
409 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  37.11 
 
 
385 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.84 
 
 
392 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>