More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl055 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl055  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 317 aa  647    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0047  5-3 exonuclease family protein  53.87 
 
 		 304 aa  342  7e-93  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 895 aa  210  3e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 888 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 911 aa  169  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 895 aa  168  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 883 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  32.24 
 
 		 876 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 896 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  36.05 
 
 		 878 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.89 
 
 		 878 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  32.14 
 
 		 982 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  34.12 
 
 		 877 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  32.35 
 
 		 843 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  34.24 
 
 		 892 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 877 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 873 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 891 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 891 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 877 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 877 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 896 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 891 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 866 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 877 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 872 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 879 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  33.07 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 965 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 891 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 972 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  32.55 
 
 		 877 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  29.87 
 
 		 885 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 876 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  31.62 
 
 		 953 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 876 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  32.55 
 
 		 877 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  31.52 
 
 		 1025 aa  152  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 924 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 866 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 866 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 893 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 888 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  30.28 
 
 		 917 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 977 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  32.3 
 
 		 891 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  31.76 
 
 		 877 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  32.81 
 
 		 894 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  32.95 
 
 		 892 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 944 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 926 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  30.28 
 
 		 912 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  32.42 
 
 		 892 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 876 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  32.42 
 
 		 892 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  31.49 
 
 		 888 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  32.95 
 
 		 982 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  31.87 
 
 		 893 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  33.73 
 
 		 926 aa  146  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  32.82 
 
 		 484 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 902 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  32.94 
 
 		 929 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  30.65 
 
 		 937 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  32.27 
 
 		 1273 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  28.95 
 
 		 953 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  29.88 
 
 		 945 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  34.36 
 
 		 892 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  30.36 
 
 		 875 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  34.6 
 
 		 858 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  32.46 
 
 		 936 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 902 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0036  5'-3' exonuclease  34.21 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.974407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  29.62 
 
 		 877 aa  142  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 880 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  32.3 
 
 		 943 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  34.19 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  30.97 
 
 		 899 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  29.61 
 
 		 930 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  29.64 
 
 		 903 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  31.46 
 
 		 1043 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  31.98 
 
 		 936 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  28.38 
 
 		 906 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  28.01 
 
 		 879 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  30.72 
 
 		 944 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  27.4 
 
 		 885 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  33.2 
 
 		 903 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 1013 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  34.11 
 
 		 896 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  32.36 
 
 		 978 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  32.54 
 
 		 846 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  33.97 
 
 		 850 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 911 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  30.57 
 
 		 945 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  30.35 
 
 		 904 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 992 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  29.19 
 
 		 972 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  29.19 
 
 		 972 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 933 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  30.68 
 
 		 910 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>