179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3349 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  96.17 
 
 		 323 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  90.94 
 
 		 319 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.55 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  52.83 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  57.28 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  46.71 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  49.03 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.64 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.7 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  44.09 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.33 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.98 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.83 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.31 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.97 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.97 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  47.97 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.07 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.07 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  44.16 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.28 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.25 
 
 		 1094 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 		 1343 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.87 
 
 		 1148 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.67 
 
 		 510 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.36 
 
 		 546 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.69 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1224 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  33.1 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.62 
 
 		 958 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.97 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1181 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.07 
 
 		 490 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.02 
 
 		 390 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.5 
 
 		 959 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.77 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.22 
 
 		 1438 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.66 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  27.47 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.88 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.04 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.78 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25.54 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.54 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.5 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 886 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.16 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.25 
 
 		 176 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.02 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.14 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.3 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.88 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  31.33 
 
 		 773 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.85 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  31.15 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.65 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.05 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.7 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.67 
 
 		 666 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3977  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  50.45 
 
 		 567 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3836  HEAT repeat-containing protein  50.45 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.31 
 
 		 1139 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.39 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3899  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  49.55 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  32.69 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.01 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  30.2 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.7 
 
 		 667 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.93 
 
 		 670 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.2 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.87 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1897  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  28.27 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  33.99 
 
 		 1194 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 1133 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.47 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.8 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.85 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.85 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.87 
 
 		 1412 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.63 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0430  putative bilin biosynthesis protein cpeZ  27.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157368  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.69 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  27.56 
 
 		 199 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.7 
 
 		 668 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  33.33 
 
 		 1137 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  26.83 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  46.99 
 
 		 354 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5727  heat domain-containing protein  26.61 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.36 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.76 
 
 		 951 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>