60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0778 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  100 
 
 		 421 aa  827    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.47 
 
 		 642 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.38 
 
 		 546 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 		 1343 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.16 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  26.77 
 
 		 643 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.75 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 593 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.3 
 
 		 1148 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.05 
 
 		 642 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1094 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.97 
 
 		 958 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  30.51 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  27.89 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.09 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  38.35 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.48 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.97 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  27.24 
 
 		 501 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.62 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 		 1412 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.24 
 
 		 959 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.07 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 1181 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  39.19 
 
 		 646 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.27 
 
 		 831 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.19 
 
 		 646 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  31.97 
 
 		 886 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.32 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.16 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  29.49 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.98 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.9 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.28 
 
 		 670 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.13 
 
 		 667 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.36 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  32.7 
 
 		 773 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.2 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  30.32 
 
 		 321 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30.69 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 		 1056 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.8 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.34 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.37 
 
 		 1438 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.8 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.95 
 
 		 1139 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.97 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  32.58 
 
 		 1137 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  27.1 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.94 
 
 		 1216 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1340  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.71 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 221 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.03 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.1 
 
 		 285 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.49 
 
 		 666 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.75 
 
 		 1041 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.97 
 
 		 220 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1224 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>