288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2802 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 343 aa  688    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  97.01 
 
 		 334 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  84.26 
 
 		 343 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  63.36 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  62.87 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  63.42 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  59.16 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  61.08 
 
 		 369 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  58.18 
 
 		 358 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  59.58 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  60.61 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  58.98 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  60 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  58.38 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  58.38 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  58.69 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  57.88 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  59.16 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  56.97 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  65.57 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  58.88 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  59.41 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  57.96 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  57.36 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  59.41 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  59.41 
 
 		 359 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  59.12 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  57.4 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  56.97 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  56.63 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  67.62 
 
 		 328 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  58.73 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  57.49 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  58.15 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  57.49 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  55.69 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  56.76 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  56.57 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  55.43 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  51.35 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  52.85 
 
 		 339 aa  345  7e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  54.25 
 
 		 353 aa  342  8e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  46.13 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  46.13 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  44.55 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.6 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.58 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  35.25 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  34 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.48 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  35.46 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  36.93 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.46 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.48 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.91 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  35.36 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  35.36 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.6 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.66 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.08 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  33.61 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.6 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 317 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  35.18 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.68 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  38.56 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.12 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.35 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.43 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.41 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  34.89 
 
 		 297 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  33.75 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>