More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2952 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2952  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 541 aa  1122    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  52.44 
 
 		 564 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0711065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  29.7 
 
 		 548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  29.7 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  29.7 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  29.25 
 
 		 555 aa  224  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 548 aa  223  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  29.52 
 
 		 566 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  29.52 
 
 		 566 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  29.36 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 552 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 542 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 546 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 		 546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 553 aa  209  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.06 
 
 		 518 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.42 
 
 		 549 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.56 
 
 		 546 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 571 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.07 
 
 		 547 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 843 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.36 
 
 		 550 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 539 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.85 
 
 		 544 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  27.73 
 
 		 571 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  29.07 
 
 		 576 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  28.92 
 
 		 575 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.04 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 489 aa  193  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  28.82 
 
 		 576 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  27.54 
 
 		 571 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  27.74 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  29.2 
 
 		 578 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.25 
 
 		 547 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  27.44 
 
 		 570 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  29.33 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  29.08 
 
 		 579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 558 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.02 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.11 
 
 		 539 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 534 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.94 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.11 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.04 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  28.26 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  28.35 
 
 		 570 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  28.35 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.07 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  28.3 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  28.35 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  28.89 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  28.35 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1545  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.07 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  28.3 
 
 		 576 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  30.54 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  26.48 
 
 		 550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  29.38 
 
 		 538 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 573 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  28.11 
 
 		 576 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  28.3 
 
 		 575 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  28.3 
 
 		 575 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 630 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.28 
 
 		 552 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.42 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  27.72 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 513 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  30.04 
 
 		 568 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  28.9 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 		 576 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  29.01 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  26.74 
 
 		 543 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  27.81 
 
 		 574 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 585 aa  179  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  28.81 
 
 		 578 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  28.43 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  27.9 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.9 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  28.73 
 
 		 564 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  30.99 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  28.1 
 
 		 568 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  29.18 
 
 		 538 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>