116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2363 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  100 
 
 		 307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  48.14 
 
 		 438 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 440 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 436 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  45.1 
 
 		 436 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 444 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  51.18 
 
 		 439 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  46.13 
 
 		 440 aa  231  9e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 444 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 		 444 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  45.85 
 
 		 408 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 420 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 453 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 442 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 457 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 		 456 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 444 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  37.89 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  42.91 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 427 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.17 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  25.97 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 441 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  23.81 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 426 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  26.29 
 
 		 452 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 418 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 426 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 431 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 404 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.04 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 429 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 419 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  26.3 
 
 		 527 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 442 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 425 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  33.58 
 
 		 688 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.42 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  24.88 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.52 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  25.99 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  22.91 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  22.64 
 
 		 440 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  22.52 
 
 		 412 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  23.33 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  22.52 
 
 		 412 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 440 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 428 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  23.27 
 
 		 412 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.27 
 
 		 412 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.27 
 
 		 412 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  25.44 
 
 		 526 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 456 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.31 
 
 		 448 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  22.48 
 
 		 419 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 417 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  27.05 
 
 		 530 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.06 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 450 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  29.3 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  24.66 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 429 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>