68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1827 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  100 
 
 		 227 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  60.2 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  58.25 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  60.11 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  55.39 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  52.58 
 
 		 212 aa  198  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  41.45 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  37.89 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  36.32 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  39.53 
 
 		 200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  39.53 
 
 		 200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.2 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  36.41 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  36.07 
 
 		 200 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  31.55 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  36.07 
 
 		 200 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4283  hypothetical protein  60.19 
 
 		 142 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  29.67 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.67 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.33 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  34.44 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.25 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.81 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.81 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.02 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.02 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  38.79 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.39 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.9 
 
 		 191 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5451  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.1 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.79 
 
 		 313 aa  88.6  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  37.35 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.11 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1758  Exopolysaccharide synthesis ExoD  35.79 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.15 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  37.66 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  30.56 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.15 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.72 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  36.75 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5628  exopolysaccharide synthesis ExoD  35 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411355  normal  0.038562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  31.05 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.67 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  31.96 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.98 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.98 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.52 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  30.1 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.33 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.29 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00184  ExoD protein  29.53 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.9 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.57 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.21 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.33 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  34.29 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.57 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  33.13 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.9 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  30.34 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0863  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.48 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  32.32 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.2 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01278  probable exopolysaccharide synthesis protein  26.23 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.17 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.54 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  42.27 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.78 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>