More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1358 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  100 
 
 
428 aa  863    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  72.37 
 
 
428 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  72.37 
 
 
428 aa  621  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  72.6 
 
 
428 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  66.9 
 
 
431 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  65.09 
 
 
430 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  61.76 
 
 
429 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  63.68 
 
 
430 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  63.01 
 
 
434 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  57.34 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  57.11 
 
 
437 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  55.21 
 
 
433 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  55.92 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  55.45 
 
 
436 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  54.98 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.21 
 
 
433 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  55.21 
 
 
436 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.87 
 
 
434 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.43 
 
 
430 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.74 
 
 
434 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.92 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.4 
 
 
434 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.82 
 
 
433 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  54.03 
 
 
438 aa  428  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.9 
 
 
439 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.9 
 
 
446 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  48.93 
 
 
432 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  50.24 
 
 
425 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.12 
 
 
424 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 
425 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.07 
 
 
423 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  47.67 
 
 
436 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  48.36 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.51 
 
 
434 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  48.57 
 
 
432 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.84 
 
 
430 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  39.39 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.35 
 
 
447 aa  318  1e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  38.77 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.9 
 
 
424 aa  302  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.53 
 
 
422 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.86 
 
 
438 aa  295  1e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.91 
 
 
425 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.53 
 
 
425 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.68 
 
 
424 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 
428 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.59 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.59 
 
 
427 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.32 
 
 
441 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.15 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.92 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  37.95 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  42.11 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.03 
 
 
425 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37 
 
 
434 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.25 
 
 
426 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.17 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.04 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  43.54 
 
 
409 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  37.99 
 
 
431 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.88 
 
 
428 aa  269  8e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.75 
 
 
429 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.78 
 
 
428 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  38.21 
 
 
431 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 
434 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  38.37 
 
 
425 aa  266  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.65 
 
 
433 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.53 
 
 
433 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  38.7 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  38.7 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  38.7 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  38.7 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  38.7 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  38.7 
 
 
425 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.63 
 
 
429 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.16 
 
 
436 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.3 
 
 
433 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  38.46 
 
 
425 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.43 
 
 
426 aa  262  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  37.89 
 
 
425 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  38.22 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  38.84 
 
 
433 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  37.65 
 
 
423 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  37.65 
 
 
423 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  35.21 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  36.58 
 
 
424 aa  259  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  37.65 
 
 
425 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  40.32 
 
 
429 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  37.65 
 
 
423 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  36.94 
 
 
423 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 
429 aa  257  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  35.07 
 
 
431 aa  255  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  36.57 
 
 
431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  35.53 
 
 
431 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.65 
 
 
432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  37.53 
 
 
431 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3062  dihydroorotase  39.9 
 
 
409 aa  252  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  37.18 
 
 
423 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  35.82 
 
 
425 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>