189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0278 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
487 aa  969    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  45.88 
 
 
484 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  49.07 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  47.52 
 
 
484 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  47.73 
 
 
464 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  43.94 
 
 
490 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  46.61 
 
 
472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  42.94 
 
 
495 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  42.14 
 
 
495 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  44.08 
 
 
486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  44.51 
 
 
486 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  42.16 
 
 
493 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  41.85 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  39.92 
 
 
485 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  38.7 
 
 
489 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  40.12 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  39.67 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  39.26 
 
 
487 aa  282  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  35.58 
 
 
456 aa  269  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 
485 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 
482 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.86 
 
 
486 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 
481 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 
481 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
487 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.13 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  26.31 
 
 
485 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  30.43 
 
 
588 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  27.56 
 
 
626 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  29.7 
 
 
619 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  29.22 
 
 
623 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 
632 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 
623 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 
632 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 
632 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  29.83 
 
 
622 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 
587 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.76 
 
 
623 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.35 
 
 
611 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 
613 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  28.3 
 
 
627 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  22 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  29.43 
 
 
588 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.6 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.56 
 
 
818 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  26.13 
 
 
618 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  22.57 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  28 
 
 
599 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 
457 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  21.36 
 
 
537 aa  77  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  26.13 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  21.79 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 
623 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  22.57 
 
 
477 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  22.79 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.21 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  21.33 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  21.22 
 
 
696 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  19.76 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  23.82 
 
 
697 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  23.46 
 
 
838 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  24.92 
 
 
665 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 
704 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 
713 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  20 
 
 
846 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  21.6 
 
 
457 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  22.8 
 
 
471 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  22.88 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 
482 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  24.07 
 
 
638 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 
626 aa  64.3  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  20.77 
 
 
847 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.16 
 
 
623 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  24.71 
 
 
637 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  22.22 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  23.95 
 
 
463 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.35 
 
 
683 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  22.11 
 
 
486 aa  60.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
457 aa  60.1  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  20.89 
 
 
477 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  21.06 
 
 
480 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  24.24 
 
 
858 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  22.05 
 
 
698 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  21.12 
 
 
858 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  21.12 
 
 
858 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  22.7 
 
 
638 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  21.55 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  24.67 
 
 
640 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 
683 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.4 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0826  protein of unknown function DUF1078 domain protein  25.31 
 
 
831 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00495264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  24.01 
 
 
413 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  21.96 
 
 
588 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  21.38 
 
 
641 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 
629 aa  57.4  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  23.53 
 
 
639 aa  57  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  21.98 
 
 
641 aa  56.6  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  21.32 
 
 
638 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>