More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2783 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  69.33 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  74.4 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  65.12 
 
 		 146 aa  176  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  64.23 
 
 		 158 aa  171  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  46.26 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  43.51 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  50.41 
 
 		 232 aa  116  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  49.46 
 
 		 268 aa  101  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  41.88 
 
 		 205 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  41.09 
 
 		 202 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  49.46 
 
 		 202 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  39.69 
 
 		 217 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  40.71 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  43.62 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  47.87 
 
 		 189 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  45.45 
 
 		 577 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  39.6 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  36.64 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  39.23 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  41.67 
 
 		 510 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  36 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  41.67 
 
 		 499 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  41.67 
 
 		 499 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.69 
 
 		 601 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  40.74 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  41.28 
 
 		 520 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  41.28 
 
 		 520 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  41.28 
 
 		 520 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  41.28 
 
 		 520 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.54 
 
 		 516 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  41.28 
 
 		 520 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  41.28 
 
 		 520 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  41.28 
 
 		 516 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  34.35 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  37.84 
 
 		 222 aa  80.1  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  44.95 
 
 		 479 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  39.09 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  38.53 
 
 		 251 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  32.82 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  38.61 
 
 		 331 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  36.67 
 
 		 773 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  40.7 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  41.3 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.93 
 
 		 1068 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 669 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  38.02 
 
 		 428 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  40.91 
 
 		 675 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 407 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  40.21 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  36.61 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  37.38 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.35 
 
 		 726 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  34.13 
 
 		 437 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.66 
 
 		 1055 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  34.71 
 
 		 708 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  37.37 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  36.94 
 
 		 481 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  40.66 
 
 		 587 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  37.37 
 
 		 338 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.21 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  39.45 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  42.53 
 
 		 675 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 712 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.59 
 
 		 575 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  36.52 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.09 
 
 		 432 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.9 
 
 		 432 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 432 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 432 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.49 
 
 		 417 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  34.91 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 432 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.96 
 
 		 439 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.9 
 
 		 432 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.49 
 
 		 417 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  35.16 
 
 		 438 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 432 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 451 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  37.61 
 
 		 389 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  37.61 
 
 		 389 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  36.13 
 
 		 439 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  37.23 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  38.54 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.11 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  36.7 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>