139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2058 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  59.42 
 
 
163 aa  173  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.31 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.88 
 
 
151 aa  160  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  55.73 
 
 
144 aa  149  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  39.23 
 
 
144 aa  103  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  38.41 
 
 
144 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  38.97 
 
 
144 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  35.97 
 
 
149 aa  100  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1559  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  34.94 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  36.14 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.94 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  36.46 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.94 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.39 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.94 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  33.68 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  35.82 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.68 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  30.19 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.94 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  34.85 
 
 
126 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.94 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  35.11 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  34.94 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.85 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.73 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.52 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.76 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.14 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  33.78 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  44.64 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.23 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  32.56 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.16 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  30.19 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.62 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
111 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  34.29 
 
 
121 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  34.29 
 
 
121 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.85 
 
 
125 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.76 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  31.82 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  30.59 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.75 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.14 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  44 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.67 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  34.67 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  35.37 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  24.41 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0361  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.53 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  35.53 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  35.53 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.31 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.47 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.47 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.31 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.67 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  33.82 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  33.82 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08920  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  30.34 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.85 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  28.74 
 
 
189 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  37.04 
 
 
125 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.69 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>