111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1726 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1726  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  32.06 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.07 
 
 		 261 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 		 194 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  33.57 
 
 		 201 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.53 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  33.57 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  32.06 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  32.06 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  30.88 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.85 
 
 		 220 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  34.35 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  36.15 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  32.06 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  27.78 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  29.23 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.06 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  29.2 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  31.54 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  29.2 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.24 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 596 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  26.72 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  30.47 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  29.71 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  28.87 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  31.78 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  30.53 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  29.32 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0278  beta-Ig-H3/fasciclin  29.29 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216669  normal  0.0952762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  31.25 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  26.67 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  28.91 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  28.33 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  29.2 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.48 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  27.48 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  27.48 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  30.07 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  28.15 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  27.21 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  27.89 
 
 		 238 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  26.56 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  35.45 
 
 		 215 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  28.17 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  28.47 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  25.38 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  29.51 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  24.83 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  28.67 
 
 		 187 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  28.15 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  25.76 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  29.23 
 
 		 611 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  25.2 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.05 
 
 		 558 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3160  beta-Ig-H3/fasciclin  26.21 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  25.38 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  27.83 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  28.35 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  27.41 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  28.8 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  28.24 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  24.82 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  26.06 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  25.41 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  25.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  27.27 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  29.37 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  26.24 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  29.08 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  24.24 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  26.92 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  26.23 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  26.61 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  28.68 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  28.68 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  24.06 
 
 		 330 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  26.92 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  24.07 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  23.58 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  25.52 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  25.56 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  25.5 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03900  expressed protein  28.57 
 
 		 439 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  24.67 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>