More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0483 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  705    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  48.6 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  46.74 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  46.83 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  43.66 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  36.97 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  41.72 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  38.38 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  43.35 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  32.7 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  38.75 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  33.33 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  35.66 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  33.55 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  34.72 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  36.31 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  35.88 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  32.23 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  32.87 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  32.87 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  38.36 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  34.49 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  34.72 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  32.07 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  35.49 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  34.38 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.87 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  34.96 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  33.67 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  38.46 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  32.33 
 
 		 422 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  31.63 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  30.3 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  31.27 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  37.31 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  30.34 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  30.66 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  28.72 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  30.27 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  32.3 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  27.59 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  24.91 
 
 		 287 aa  106  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  30.45 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  30.45 
 
 		 304 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  30.86 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  25.49 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.61 
 
 		 288 aa  99.4  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  30.68 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  28.22 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.34 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  28.66 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  27.03 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  30.21 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  33.48 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.52 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  31.22 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  29.57 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  31.22 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 291 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  31.33 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.51 
 
 		 291 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  32.13 
 
 		 289 aa  85.9  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  32.31 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  31.84 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  30.41 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  32.02 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  27.97 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  32.62 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  31.51 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  31.58 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  30.22 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  31.34 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  31.34 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  33.15 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  33.15 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  29.54 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  29.46 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  28.89 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  29.11 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  31.28 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  29.28 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  29.36 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  27.6 
 
 		 252 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>