204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1434 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5896  glycoside hydrolase 15-related  81.71 
 
 
609 aa  1013    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0215966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1434  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
616 aa  1256    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  91.72 
 
 
628 aa  1165    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  38.73 
 
 
595 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  39.63 
 
 
625 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  39.31 
 
 
613 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  38.53 
 
 
598 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  38.29 
 
 
601 aa  361  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  39.97 
 
 
586 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  38.33 
 
 
599 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  37.36 
 
 
612 aa  355  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  39.73 
 
 
594 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  39.8 
 
 
596 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  37.92 
 
 
596 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  38.71 
 
 
619 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  38.12 
 
 
602 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  38.45 
 
 
597 aa  345  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  36.77 
 
 
599 aa  345  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  38.46 
 
 
602 aa  343  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  38.59 
 
 
594 aa  343  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  37.75 
 
 
645 aa  343  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  37.95 
 
 
602 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  37.39 
 
 
599 aa  342  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  36.79 
 
 
617 aa  340  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  36.98 
 
 
623 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  38.09 
 
 
627 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  37.82 
 
 
600 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  38.71 
 
 
603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  36.82 
 
 
623 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  36.73 
 
 
612 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  36.59 
 
 
613 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  37.86 
 
 
601 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  38.31 
 
 
596 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  37.16 
 
 
598 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  36.17 
 
 
679 aa  334  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  37 
 
 
626 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  37.04 
 
 
612 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  36.76 
 
 
665 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  38.89 
 
 
602 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  36.81 
 
 
609 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  37.46 
 
 
598 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  36.82 
 
 
610 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  36.97 
 
 
627 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  36.68 
 
 
868 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  36.2 
 
 
609 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  36.36 
 
 
605 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  36.36 
 
 
609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  36.71 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  38.59 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  35.31 
 
 
636 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  36.69 
 
 
594 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  35.9 
 
 
629 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  35.98 
 
 
611 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  36.99 
 
 
598 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  37.68 
 
 
617 aa  326  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  36.64 
 
 
610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  37.24 
 
 
611 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.79 
 
 
600 aa  325  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  36.87 
 
 
621 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  35.97 
 
 
628 aa  324  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  36.32 
 
 
626 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  36.29 
 
 
601 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  36.72 
 
 
593 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  35.86 
 
 
609 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  35.86 
 
 
609 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  37.25 
 
 
617 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  37.71 
 
 
616 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.03 
 
 
601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 
608 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 
606 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  35 
 
 
636 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  35.69 
 
 
609 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  34.61 
 
 
608 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 
677 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  34.59 
 
 
617 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 
677 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  36.49 
 
 
605 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 
605 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  34.26 
 
 
677 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  36.29 
 
 
608 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  37.56 
 
 
611 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  37.15 
 
 
621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  36.5 
 
 
613 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  34.08 
 
 
619 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  36.13 
 
 
617 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  33.49 
 
 
642 aa  312  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  34.25 
 
 
672 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  33.59 
 
 
656 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  36.11 
 
 
620 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  33.89 
 
 
609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  34.38 
 
 
635 aa  308  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  33.98 
 
 
668 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  34.79 
 
 
887 aa  307  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  36.04 
 
 
619 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>