More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0526 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0526  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
157 aa  314  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0113  PAS sensor protein  76.6 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3363  PAS sensor protein  72.92 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.435353  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4785  PAS sensor protein  72.92 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1662  putative PAS/PAC sensor protein  74.82 
 
 
157 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18425  normal  0.642578 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6357  PAS sensor protein  60.68 
 
 
156 aa  153  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1140  putative PAS/PAC sensor protein  54.05 
 
 
132 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  43.64 
 
 
326 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
336 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
336 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
336 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2903  putative PAS/PAC sensor protein  39.45 
 
 
400 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.097748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0882  putative PAS/PAC sensor protein  38.83 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5593  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 
448 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  37.04 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  37.14 
 
 
425 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1833  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
687 aa  81.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
1562 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.11 
 
 
424 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4536  putative PAS/PAC sensor protein  38.32 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.23 
 
 
419 aa  79  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
578 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 
723 aa  77.4  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1159  PAS:GGDEF  30.66 
 
 
748 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
884 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  36.89 
 
 
541 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
1877 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  36.89 
 
 
541 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 
365 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0474  sensory box/GGDEF family protein  36.92 
 
 
792 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1348  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  29.93 
 
 
763 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 
1238 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1778  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0428766  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.4 
 
 
1059 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.192885 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35077  predicted protein  31.37 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1692 aa  71.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2006  putative blue-light photoreceptor  36.28 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0395879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  33.01 
 
 
534 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.33 
 
 
929 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
873 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1488  PAS  31.62 
 
 
531 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0812  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
416 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137039  normal  0.392599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.42 
 
 
989 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  34.95 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.91 
 
 
989 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  34.91 
 
 
507 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0219  hypothetical protein  27.59 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.62 
 
 
1183 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.73 
 
 
1034 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1688  diguanylate cyclase  34.74 
 
 
546 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.62 
 
 
1183 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  34.26 
 
 
581 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
416 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0511  putative PAS/PAC sensor protein  32.71 
 
 
495 aa  68.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3170  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0594815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 
760 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.25 
 
 
905 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.09 
 
 
709 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1510  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.25 
 
 
581 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.865852  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  30.61 
 
 
1057 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32 
 
 
578 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  30.4 
 
 
680 aa  67  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
491 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  32 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0219  hypothetical protein  26.72 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1820 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.38 
 
 
1021 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.39 
 
 
920 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  30.1 
 
 
534 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
1741 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
812 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0896  sensor protein  28.23 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.73 
 
 
481 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.58 
 
 
764 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.210593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  36.36 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.36 
 
 
1027 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  35.14 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
1138 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.03 
 
 
587 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5660  hypothetical protein  32.79 
 
 
839 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.32582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
654 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  32.58 
 
 
1178 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  32 
 
 
463 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2558  signal transduction protein  29.82 
 
 
1061 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
959 aa  65.1  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.37 
 
 
1238 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  33.01 
 
 
539 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.62 
 
 
1040 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  33.33 
 
 
533 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2926  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.73 
 
 
461 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000284142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
991 aa  63.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
354 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
1568 aa  63.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
681 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2739  sensory box protein, putative  30.33 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0904  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2228  PAS domain-containing protein  32.85 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>