More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0036 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 148 aa  296  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  68.49 
 
 		 162 aa  209  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  53.38 
 
 		 149 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  52.78 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  49.32 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  52.74 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  51.72 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  47.95 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  50.68 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  50.34 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  45.64 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  44.3 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  44.3 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  42.95 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  46.48 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  41.61 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  45.77 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  44.37 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  43.88 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  42.96 
 
 		 174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  43.88 
 
 		 171 aa  126  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  44.14 
 
 		 157 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  40.28 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  41.3 
 
 		 194 aa  114  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  39.19 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  45.21 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  41.73 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  37.59 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.78 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  36.36 
 
 		 165 aa  90.9  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  34.72 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  38.89 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  37.5 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  36.81 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  36.11 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  34.97 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  31.94 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  32.17 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  37.21 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  32.17 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  32.64 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  32.17 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  37.98 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  36.43 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  37.21 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  36.43 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  37.5 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  29.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  37.98 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  32.56 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  37.21 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  34.48 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  34.48 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  31.01 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  33.8 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  35.66 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  31.78 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>