205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2256 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  70.16 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  40.93 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  38.49 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  40.76 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  40.27 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  37.07 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  36.64 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 288 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.84 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  27.33 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  29.07 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  29.3 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.8 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  30.13 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.8 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  33.56 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.17 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.42 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  25.15 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  27.82 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  24.56 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  29.23 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 378 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3273  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, inner membrane subunit  26.95 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.46 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4006  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.34 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  31.34 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.1 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.86 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.49 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  27.01 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  25.49 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.87 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  32.45 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  31.11 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  29.69 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.7 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.86 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.93 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  27.95 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.41 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 375 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  38.04 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  31.1 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  31.1 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  30 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 363 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  30 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  27.06 
 
 		 268 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  26.15 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  30.82 
 
 		 378 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>