More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3192 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 326 aa  669    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  63.19 
 
 		 326 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  57.96 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  54.7 
 
 		 313 aa  298  9e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  52.17 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  47.08 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  47.37 
 
 		 331 aa  281  9e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  45.54 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  44.31 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  47.45 
 
 		 324 aa  276  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  46.33 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  44.17 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  43.77 
 
 		 359 aa  258  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  43.4 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  43.4 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.47 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  38.62 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  40.89 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  35.87 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.92 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  37.91 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.29 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.66 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.52 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  37.03 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  35.22 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.93 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  38.93 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.61 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  34.91 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  36.84 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  32.3 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  34.05 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  36.09 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  36.49 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  34.65 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  36.92 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  36.92 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.83 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  35.69 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.36 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.77 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.65 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.02 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  34.47 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  36.11 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  33.99 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  34.44 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  34.74 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  34.89 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  33.59 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  31.27 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  37.9 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.99 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.49 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  33.23 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  29.1 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>