More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2672 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  69.21 
 
 		 302 aa  455  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  50.17 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  46.55 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  42.86 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  44.11 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  44.26 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  40.95 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  41.1 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  41.46 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  37.81 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  43.33 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  42.33 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  37.21 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  40.33 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  37.54 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  37.46 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  37.54 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  34.22 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  34.22 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  35.97 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  36.45 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  35.37 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  37.3 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  33.66 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  35.64 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  35.88 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  36.66 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  36.01 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  35.18 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  33.33 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  35.13 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  32.78 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  36.57 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  33.22 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  32.34 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  32.55 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  36.61 
 
 		 376 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  32.45 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  32.45 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  32.46 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  28.67 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  32 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  29.87 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  33.56 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  29.53 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  31.37 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  29.67 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  26.91 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  29 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.29 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  29.93 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.83 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  29.67 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  26.82 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.85 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  31.7 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  31.94 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  30.6 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  28.28 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  30.6 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  28.7 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  30.12 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  31.13 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  30.67 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  31.13 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  34.08 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  30.66 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  28.97 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0863  C32 tRNA thiolase  31.92 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  29.96 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  30.91 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  30.19 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  29.2 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  28.27 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  32.3 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  30.97 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  29.15 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  32.3 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  30.91 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  30.66 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  30.53 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  28.62 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  28.77 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  28.27 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  29.96 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  28.11 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>